Der Instrumentalunterricht der Musikschule Wil findet hauptsächlich in der Musikschule Sonnenhof und der Musikschule Lindenhof statt. Der Grundkurs und Blockflötenunterricht wird in der Regel im Schulhaus der Volksschule angeboten. Weitere Unterrichtsorte befinden sich in Bronschhofen und Rossrüti.