Kindergarten und Primarschule: Im Kindergarten und der Primarschule wird in der Stadt Wil grundsätzlich integrativ unterrichtet. Auf der Primarstufe werden jedoch für die 3. bis 6. Klasse zentral zwei Kleinklassen mit sozialpädagogischer Ausrichtung geführt.
Oberstufe: Die Oberstufe ist gegliedert in Sekundar- und Realklassen. Zusätzlich wird an allen drei Oberstufen je eine Kleinklasse geführt.
Integrationsklassen: In der Primar- und Oberstufe werden insgesamt drei Integrationsklassen für Fremdsprachige geführt. In der Integrationsklasse besuchen fremdsprachige Kinder und Jugendliche, welche direkt aus dem Ausland zuziehen, den Unterricht.
Sportschule Lindenhof: Die Oberstufe Lindenhof ist zertifizierte Swiss Olympic Partner School. Mehr zur Sportschule auf der Website der Oberstufe Lindenhof.